W przeciwieństwie do bocianów białych gatunek ten jest płochliwym i skrytym samotnikiem
Bocian czarny, zwany inaczej hajstrą, podobnie jak jego biały kuzyn jest dość szeroko rozprzestrzeniony na naszym kontynencie. Występuje także w Polsce, lecz z uwagi na fakt, że stroni od kontaktu z człowiekiem i wybiera raczej leśne ostępy niż wiejskie pola i łąki, niewiele osób ma okazję spotkać go w naturze.
Populację europejską szacuje się na 7000 – 11000 par lęgowych, najliczniej występuje w Polsce i na Białorusi
